北交所是一套以注册制为核心、专门适配创新型中小企业，由发行上市、交易、持续监管、投资者适当性共同构成的差异化资本市场制度体系，整体脱胎于新三板精选层制度框架，和沪深交易所形成错位发展格局。
北交所实行证券公开发行注册制，坚持以信息披露为中心，上市企业必须先在新三板创新层连续挂牌满12个月，满足四套差异化上市标准之一即可申报，上市门槛更加包容，兼顾企业盈利水平、营收增速、研发实力与市场估值，允许部分未盈利创新企业申报上市。审核流程精简高效，同时严格压实上市公司、保荐机构信息披露责任，企业成功上市后，还可以依规筹划向科创板、创业板转板，打通中小企业向上发展的资本市场通道。
交易制度是北交所制度最直观的特色，市场实行T+1连续竞价交易，新股上市首日不设置涨跌幅限制，盘中价格波动达到30%、60%两档阈值会触发临时停牌，上市次日起日常涨跌幅限制设置为30%，波动空间高于科创板、创业板。交易申报门槛为100股起买，支持1股递增申报，搭配竞价交易、大宗交易、做市商等多元交易模式；同时设置严格的投资者适当性门槛，个人投资者需要满足24个月证券交易经验，开通权限前20个交易日日均证券资产不低于50万元，以此匹配板块更高的价格波动风险。
北交所搭建了适配中小企业特征的监管规则，信息披露要求兼顾企业运营成本与投资者知情权，简化部分非核心披露事项。退市机制遵循市场化导向，设置财务类、交易类、规范类、重大违法类多元退市指标，和沪深市场不同，北交所退市企业在符合条件情况下，可以退回新三板创新层、基础层继续挂牌交易，并非直接退出资本市场，构建起有进有出、分层流转的良性生态。依托这套制度，北交所和新三板基础层、创新层形成层层递进的完整市场链条，承担培育专精特新中小企业的功能。
